Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp17lcG5E8I7 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms