Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms