Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.6 ms