Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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Myo5cE9Q1F5 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Myo5cE9Q1F5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms