Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms