Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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