Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms