Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms