Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms