Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms