Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CcniQ9Z2V9 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
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