Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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