Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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