Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms