Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms