Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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