Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms