Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lin37Q9D8N6 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lin37Q9D8N6 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lin37Q9D8N6 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lin37Q9D8N6 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lin37Q9D8N6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lin37Q9D8N6 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lin37Q9D8N6 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lin37Q9D8N6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lin37Q9D8N6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms