Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms