Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Nop56Q9D6Z1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Nop56Q9D6Z1 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Nop56Q9D6Z1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Nop56Q9D6Z1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nop56Q9D6Z1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nop56Q9D6Z1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nop56Q9D6Z1 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nop56Q9D6Z1 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nop56Q9D6Z1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nop56Q9D6Z1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nop56Q9D6Z1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Nop56Q9D6Z1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Nop56Q9D6Z1 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nop56Q9D6Z1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nop56Q9D6Z1 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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