Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms