Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc81Q9D5W4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms