Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms