Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms