Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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