Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms