Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Pin4Q9CWW6 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Pin4Q9CWW6 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Pin4Q9CWW6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Pin4Q9CWW6 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Pin4Q9CWW6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Pin4Q9CWW6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Pin4Q9CWW6 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Pin4Q9CWW6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pin4Q9CWW6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms