Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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