Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms