Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms