Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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