Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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