Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms