Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms