Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Slc6a20aQ8VDB9 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Slc6a20aQ8VDB9 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Slc6a20aQ8VDB9 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Slc6a20aQ8VDB9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Slc6a20aQ8VDB9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Slc6a20aQ8VDB9 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Slc6a20aQ8VDB9 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Slc6a20aQ8VDB9 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Slc6a20aQ8VDB9 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Slc6a20aQ8VDB9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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