Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
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LgsnQ8CIX8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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LgsnQ8CIX8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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LgsnQ8CIX8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LgsnQ8CIX8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LgsnQ8CIX8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LgsnQ8CIX8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LgsnQ8CIX8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LgsnQ8CIX8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LgsnQ8CIX8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LgsnQ8CIX8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LgsnQ8CIX8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms