Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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