Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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