Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC21

Ttc19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc19Q8CC21 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ttc19Q8CC21 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ttc19Q8CC21 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ttc19Q8CC21 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ttc19Q8CC21 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ttc19Q8CC21 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Ttc19Q8CC21 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc19Q8CC21 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Ttc19Q8CC21 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc19Q8CC21 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc19Q8CC21 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ttc19Q8CC21 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc19Q8CC21 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc19Q8CC21 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc19Q8CC21 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc19Q8CC21 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc19Q8CC21 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc19Q8CC21 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc19Q8CC21 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc19Q8CC21 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc19Q8CC21 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc19Q8CC21 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc19Q8CC21 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc19Q8CC21 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc19Q8CC21 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc19Q8CC21 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc19Q8CC21 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc19Q8CC21 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc19Q8CC21 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc19Q8CC21 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms