Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usp20Q8C6M1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usp20Q8C6M1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usp20Q8C6M1 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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