Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms