Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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FarsaQ8C0C7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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FarsaQ8C0C7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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FarsaQ8C0C7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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FarsaQ8C0C7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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FarsaQ8C0C7 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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FarsaQ8C0C7 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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FarsaQ8C0C7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms