Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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