Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcl16Q8BSU2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms