Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms