Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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