Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Amigo1Q80ZD8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Amigo1Q80ZD8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Amigo1Q80ZD8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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