Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rexo1Q7TT28 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rexo1Q7TT28 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms