Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms