Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms